双轴自动跟踪器跟踪控制系统使用两种跟踪控制方式，其一为光控，即使用光传感器，跟据天空不同区域光线强弱区别，判断太阳位置，然后驱动电机转动支架进行追踪。
双轴自动跟踪器其二为时控，根据当地经纬坐标和时间，利用天文学计算公式，计算太阳所处天空的坐标，然后驱动电机转动支架进行追踪。
目前国内公司多将两种控制原理结合，时控为主，光控为辅，即天气良好的情况下，利用时控追踪太阳大约位置，然后利用光控进行**调节，天气条件不好的情况下，单独利用时控进行追踪，避免天空杂光干扰。
另外也可以采用另一种结合方式：仍然以时控为主，光控为辅，即天气良好的情况下，单纯利用光控进行追踪，如果遇到阴雨天气，则自动转跳到时控方式进行追踪。
时控方式中，使用GPS 模块来获取当地的经纬度和时间。保证坐标和时间的精度，从而提高追踪**程度。
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